氣相色譜儀對氣體純度有較高要求，氣體純度高可以保持儀器的高度靈敏以及使用壽命，如若所用氣體的純度不符合要求的低純度氣體，會對氣相色譜儀造成以下一系列不良影響;

        （1）進樣口：樣品易氧化，造成樣品分解，出現(xiàn)鬼峰等；

        （2）色譜柱：色譜柱內(nèi)填料易氧化，縮短柱使用壽命；

        （3）TCD：熱敏元件(錸鎢絲)易氧化，縮短檢測器使用壽命；

        （4）FID：噪聲大，基線不穩(wěn)定；

        （5）ECD：基線滿量程，無法調(diào)零；其原因：ECD控制器一般都采用“調(diào)制脈沖”供電方式，當(dāng)設(shè)定好預(yù)置電流（0.5、1、2nA）后，ECD控制器將發(fā)出脈沖電平，使通過檢測器內(nèi)的載氣被放射源電離的形成電子，在收集脈沖的作用下，在運算放大器輸入端進行減法運算，直至輸出為零，如果載氣純度不夠（主要是含氧量過高），載氣被放射源電離的形成電子流偏低，與設(shè)定預(yù)置電流不能抵消為零，就會造成運算放大器（積分運算放大器）輸出飽和；無法調(diào)零。

        （6）FPD：噪聲大，基線不穩(wěn)定；

        （7）NPD：噪聲大，基線不穩(wěn)定。

     長期使用較低純度的氣體氣源，很容易對氣相色譜儀檢測器及氣路造成污染，要想恢復(fù)儀器的高靈敏度時十分困難，所有建議大家使用高純氣。